ก็อดซิลล่าผจญต้นไม้ปีศาจ

หลังจากโลกเคยเผชิญกับหายนะจากการอาละวาดของก็อดซิลล่า การแข่งขันด้านอาวุธชีวภาพก็เริ่มต้นขึ้นอย่างลับๆ ก็อดซิลล่าผจญต้นไม้ปีศาจ ถ่ายทอดเรื่องราวของรัฐบาลญี่ปุ่นที่พยายามใช้เซลล์ของก็อดซิลล่าสร้างอาวุธชนิดใหม่อย่าง ANEB แบคทีเรียต่อต้านพลังงานนิวเคลียร์ เพื่อเตรียมรับมือหากราชันอสูรกายกลับมาอีกครั้ง แต่การทดลองทางพันธุกรรมกลับนำไปสู่การกลายพันธุ์อันน่าสะพรึง เมื่อสิ่งมีชีวิตจากพืชเริ่มวิวัฒนาการจนกลายเป็นภัยคุกคามร้ายแรงต่อมนุษยชาติ นักพันธุศาสตร์ เกนชิโร ชิรากามิ ต้องเผชิญหน้ากับผลลัพธ์ของงานวิจัยที่เกินควบคุม ขณะที่ก็อดซิลล่ากลับมาอีกครั้งเพื่อนำพาโลกเข้าสู่สงครามครั้งใหม่ระหว่างสัตว์ประหลาดและสิ่งมีชีวิตกลายพันธุ์สุดอันตราย